Một trong những vai diễn ấn tượng nhất trong sự nghiệp của Lee Jun Ki chính là vai chàng hề Gong Gil. Gong Gil là anh hề nổi tiếng thời đại Chosun, có ngoại hình đẹp như một mỹ nữ. Gong Gil cùng người bạn Jang Saeng biểu diễn một tiểu phẩm châm biếm nhà vua và sủng thiếp Nok Su. Nhà vua vô tình xem được màn trình diễn ấy và vô cùng yêu thích tài nghệ của hai người. Ông cho phép Gong Gil và Jang Saeng vào cung để hầu hạ mình, đặc biệt tỏ vẻ yêu mến Gong Gil. Tình cảm này đã khiến cho phi tần Nok Su ghen tức và tìm cách trả thù. Lee Jun Ki đã hoá thân hoàn hảo thành một người đẹp phi giới tính và có nội tâm phức tạp.

Lee Geom là con trai của một gia đình quý tộc, vì biến cố mà mất trí nhớ, lưu lạc giang hồ. Geom tính tình hào sảng, hay quậy phá, đã gây ra nhiều chuyện dở khóc dở cười cho những người xung quanh. Khi lấy lại được trí nhớ, cậu cải trang thành một tên trộm bí ẩn, chuyên ăn trộm của người giàu chia cho người nghèo và cũng từng bước trả thù kẻ giết cha mình. Để có thể tự mình thực hiện những phân cảnh hành động đẹp mắt, Lee Jun Ki đã tập luyện 8 tiếng/ngày. Tạo hình phóng khoáng, rất lãng tử của nhân vật Lee Geom giúp nam diễn viên thoát khỏi cái bóng "xinh gái" trước đây.

Lee Eun Oh là vị sử đạo trẻ tuổi mới đến nhậm chức Phó sứ Mật Dương đã gặp hồn ma xinh đẹp Arang. Arang bị nhũ mẫu hại chết oan uổng nên không thể siêu thoát. Vốn bản tính cương trực, gan dạ nên Eun Oh đã quyết định giúp Arang điều tra, làm sáng tỏ cái chết. Từ đây bắt đầu một mối tình người - ma đầy lãng mạn. Bộ phim tuy không thành công như mong đợi nhưng vai Eun Oh của Lee Jun Ki được khen hết lời vì quá đẹp trai, phong độ. 

Nhân vật Park Yoon Kang của Lee Jun Ki là kiếm khách cuối cùng của thời đại Joseon, là con trai của đệ nhất kiếm Joseon. Cậu vì báo thù cho cha và em gái của mình, đã từ bỏ đao kiếm, trở thành tay súng cừ khôi. Sau này Yoon Kang trở thành anh hùng của dân tộc giữa thời đại chuyển giao loạn lạc. Trong phim, Lee Jun Ki có 2 tạo hình là cổ trang và Âu phục. Diễn xuất chắc tay cùng thần thái cổ điển rất luôn cuốn là những yếu tố giúp Lee Jun Ki "sinh ra để đóng phim cổ trang".

Kim Sung Yeol, sống dưới triều đại Joseon, là một ma cà rồng 150 tuổi. Sung Yeol còn là một học giả uyên bác, quyết dâng hiến đời mình để bảo vệ sự ổn định của Joseon. Vẻ đẹp bí ẩn, phảng phất nét ma mị của nam diễn viên rất hợp với vai diễn này. Lee jun Ki được fan nhận xét là như bước ra từ truyện tranh.

Vai diễn mới nhất của Lee Jun Ki là Tứ hoàng tử Wang So trong bom tấn cổ trang Người tình ánh trăng (Moon Lover). Chàng từ nhỏ không được vua cha yêu thương, mẫu hậu vì muốn gây sự chú ý với đức vua nên đã đối xử tàn tệ, để lại vết sẹo trên mặt chàng. Wang So tính cách thâm trầm, lạnh lùng, luôn toả ra bá khí u tối. Tạo hình của Lee Jun Ki khi mới tung ra bị chê là giống hải tặc hơn hoàng tử, tuy nhiên khi phim phát sóng, nam diễn viên đã chinh phục người xem nhờ lối diễn xuất đầy cảm xúc. Hầu hết ý kiến khán giả đều cho rằng chút bí ẩn càng làm cho Tứ hoàng tử thêm phần lôi cuốn.